我院通过十几年的不断摸索和技术引进，在化工、制革、印染、制药、造纸等工业废水处理方面积累了许多经验，先后完成了几百项工程，如上海金山石化含油废水、上海新伦纸业有限公司脱墨废水、杭州富通公司光纤废水、南京中山化工厂环氧丙烷废水、上海第四制药厂废水处理、泰州唐仁针织品有限公司针织废水、上海永安乳品有限公司污水处理、上海久新搪瓷厂污水处理、无锡微电子有限公司污水处理、上海枫泾酒厂污水处理、上海纳铁福传动轴有限公司污水处理、上海金山区污水处理、上海三药厂污水等工程，其中南京中山化工厂环氧丙烷废水治理中采用新工艺、新菌种开拓石化废水治理得新领域，受到联合国环保专家的肯定。

在城市污水方面，该院引进消化的高密度生物膜过滤及流离球技术成功应用于苏州河水质净化中试项目及上海市排海工程—金山金江污水处理厂，获得了上海市建委好评。另外该院采用改进型氧化沟、aa/ao工艺和sbr工艺，应用在南京雨花经济开发区污水处理厂、邳州市城市污水二期工程及吴江经济开发区远东污水处理厂等工程，降低了投资和运行成本。